Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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