Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms