Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms