Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm4T1NXB5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms