Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms