Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms