Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clic1Q9Z1Q5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms