Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms