Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod2Q9R0B9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms