Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Kcnip3Q9QXT8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms