Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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