Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdgfl3Q9JMG7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdgfl3Q9JMG7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdgfl3Q9JMG7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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