Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Crlf1Q9JM58 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crlf1Q9JM58 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crlf1Q9JM58 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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