Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms