Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole3Q9JKP7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms