Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx6Q9JKK1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms