Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pgpep1Q9ESW8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms