Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r56Q9EPS9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms