Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms