Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms