Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms