Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms