Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Derl3Q9D8K3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms