Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms