Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Efhd1Q9D4J1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Efhd1Q9D4J1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Efhd1Q9D4J1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms