Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clvs1Q9D4C9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms