Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933436I01RikQ9D3T1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms