Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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