Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ss18l2Q9D174 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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