Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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