Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms