Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms