Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf6Q99NA9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf6Q99NA9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms