Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp1b1Q99LU0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp1b1Q99LU0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms