Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abtb1Q99LJ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abtb1Q99LJ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abtb1Q99LJ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abtb1Q99LJ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abtb1Q99LJ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abtb1Q99LJ2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms