Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EtfaQ99LC5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms