Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nmd3Q99L48 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms