Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlcd1Q99JT6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlcd1Q99JT6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms