Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnip2Q99JG7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnip2Q99JG7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnip2Q99JG7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnip2Q99JG7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnip2Q99JG7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnip2Q99JG7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms