Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu1Q99J10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms