Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms