Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Med28Q920D3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms