Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms