Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Basp1Q91XV3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms