Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Creb3l3Q91XE9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Creb3l3Q91XE9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms