Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VDP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms