Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms