Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plac9Q8K262 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac9Q8K262 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms