Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cnppd1Q8K158 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnppd1Q8K158 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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