Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms